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Gestartet war das Obsidian-Projekt aus Unzufriedenheit mit bestehenden Notiz-Lösungen während der Coronavirus-Pandemie. Seinerzeit, im Sommer 2020, wurde die erste Version der Notiz-App nach eingehender Entwicklungsphase in Quarantäne veröffentlicht. Als grundlegende Pfeiler sollte Obsidian auf lokaler Verfügbarkeit, reinem Text, Links und Erweiterbarkeit beruhen und wurde vom Entwicklerteam als „Zweites Gehirn“ oder auch als „persönliche Wissens-Datenbank“ bezeichnet.